Curso sobre tratamiento de datos de microarrays de DNA


Este curso cubre los aspectos más importantes del análisis de datos de expresión génica obtenidos mediante la técnica de microarrays, tanto de arrays de oligonucleótidos (Affymetrix) como de cDNA. Este curso teórico-práctico pretende dar una visión de los problemas más habituales que aparecen durante el tratamiento de estos datos, así como la manera de enfrentarlos. Los temas tratados van desde el propio diseño del array (en el caso de cDNA), pasando por la lectura de datos del scanner, su procesamiento, las distintas formas de analizar los resultados, y finalmente, las conclusiones a las que se puede llegar con las herramientas informáticas actualmente disponibles (limitaciones de estas, etc.). El curso incluye el manejo de software básico y avanzado, aplicado a casos reales. El objetivo es que el alumno sea capaz de analizar datos de expresión génica provenientes de distintas plataformas y de distintos diseños experimentales, utilizando para ello las últimas metodologías desarrolladas.


Profesores: Dr. Joaquín Dopazo y Juan Carlos Oliveros.


Fechas: Abril, 2002. Fechas exactas por definir.


Duración: 1-2 dias.


Horario: Por definir.


Lugar: Por definir.


Precio: Por definir.


Programa:

  1. Introducción

  2. Diseño del array



  3. Análisis de imagen



  4. Análisis de resultados: normalización y filtrado

  5. Almacenamiento de resultados



  6. Análisis de datos de dos condiciones



  7. Análisis de datos de muchas condiciones. Clustering: métodos clasicos y nuevos. Teoría y práctica



  8. Software para la comparación de dos y muchas condiciones (scatterplots y clustering)

  9. Interpretación biológica de los datos

  10. Data-mining de los resultados. Teoría y práctica.

  11. Conclusiones y comentarios.





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